正文以上发明病根，是本段之前半截。下乃备引经义，以证其实而足其理。以上论理升降出入，是病机也。推病根，为第二段。以上推论化气，发明标本，是补足前半篇义理，为第三段。以下论五味补泻治法，退出通篇，为第四
序序凡例卷一述原引种预防禁忌辨证卷二论治（上）卷三论治（下）卷四运气选案
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分第6部分
医学发明
简介本草纲目拾遗小序卷一 水部卷二 火部·土部·金部·石部卷三 草部上卷四 草部中卷五 草部下卷六 木部卷七 藤部·花部·果部上卷八 果部下·诸谷部·诸蔬部卷九 器用部·禽部·兽部卷十 鳞部·介部·虫
《政和圣济总录》序大德重校《圣济总录》序卷第一·运气甲子岁图乙丑岁图丙寅岁图丁卯岁图戊辰岁图己巳岁图庚午岁图辛未岁图壬申岁图癸酉岁图甲戌岁图乙亥岁图丙子岁图丁丑岁图戊寅岁图己卯岁图庚辰岁图辛巳岁图壬午
卷一月经门诸论经病门诸论崩漏门诸论带下门诸论女科杂症门热入血室血分水分炙脔梅核瘕癖乳症前阴诸症？？足跟疮肿疮血风疮梦与鬼交卷二嗣育门绪论受胎总论胎前杂症门恶阻子烦妊娠烦躁口干子悬子满子肿子气妊娠腹痛胎
卷一经候门经闭痛经潮热、蒸热、寒热鼻衄带下崩漏阴肿门卷二种子门卷三胎前门恶阻胎动不安漏胎心腹胀满
卷上痘疹发微惊风卷中论望色论芤脉论人参论***杂记卷下三疟治验神水治验制神水秘法妇科验方
吴序张序自序张声驰序卷上人身一小天地论阴阳互根论五行生克论阴阳治法大要论枢机论卫气行度一经星经天论营气行度一经水行地论百病提纲论望病须察神气论卷中闻声须察阴阳论问证求病论切脉源流论内伤大要论湿气论卷下