序凡例原叙卷首诊法五脏六腑经气望色闻声问证切脉卷一证治背上头骨两耳眼目唇口鼻孔齿牙舌本咽喉胸前大腹小腹胁肋腰中手臂脚腿前阴后阴大便小便卷二证治寒热呕吐咳嗽喘失血遗精言语心神斑黄出汗肿胀饮食起居倒仆掣动
走马急疳真方
卷上卷下
卷一经候门经闭痛经潮热、蒸热、寒热鼻衄带下崩漏阴肿门卷二种子门卷三胎前门恶阻胎动不安漏胎心腹胀满
徐序柏序尤序大父拙吾府君家传卷一中风统论卒中八法中风失音不语口眼歪斜偏风历节痛风鹤膝风风缓风瘙痒诸湿统论散湿之剂渗利之剂下湿之剂上下分消之剂瘟疫大法卷二痰饮统论饮食伤食伤酒不能食谷劳食亦诸血统论风热吐
金匮玉函要略方论序金匮要略序（出赵本．）金匮玉函要略综概卷一脏腑经络先后病脉证第一（论十三首、脉证三条）湿病脉证第二（论一首、脉证十二条、方十一首）百合狐惑阴阳毒病证治第三（论一首、证三条、方十二首）
正文补编·卷上论温热病舌黄舌绛烟煤舌舌黑舌淡红无色舌白如粉验齿温热论补编·卷下崩漏标本证治崩漏虚实证治论妇女湿温病韩善征辟产后忌寒凉宜温热及大补气血论
《本草衍义》提要序卷一序例上衍义总叙卷二序例中卷三序例下内容卷四玉泉丹砂空青绿青云母石钟乳朴硝芒硝硝石英硝矾石滑石紫石英白石英赤石脂白石脂石中黄子婆娑石无名异菩萨石卷五金屑银屑水银水银粉雄黄雌黄石硫黄
锲斗垣申君校正外科启玄序序校正外科启玄自序外科启玄附痘科序后序卷之一明疮疡标本论明疮疡脉理论明疮疡是阴阳相滞论明疮疡分五善七恶论明疮疡原无定处论明疮疡色脉形症当参相应论明疮疡部位所属经络论明疮疡生十二
序自序游艺志略自序精义汇通六经提纲六字真言六气便解医经补正治病法解一治病法解二素问摘要三证合参说寒说温风温湿温说疫辨证治法指南审脉附∶游艺志略